Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2H2Q13888 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms