Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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