Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN4PQ13434 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms