Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNTA1Q13424 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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