Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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