Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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