Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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