Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms