Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2BQ13224 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
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