Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK3Q13003 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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