Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TRAF2Q12933 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF2Q12933 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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