Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROQ12816 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TROQ12816 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROQ12816 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROQ12816 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROQ12816 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TROQ12816 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROQ12816 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROQ12816 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TROQ12816 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
TROQ12816 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TROQ12816 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TROQ12816 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TROQ12816 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
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