Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP160Q12769 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP160Q12769 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms