Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 FIG4YNL325C 2640 nt2.07□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.06□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 IBA57YJR122W 1494 nt2.06□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 RGA2YDR379W 3030 nt2.06□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 HRI1YLR301W 735 nt2.05□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 SCP1YOR367W 603 nt2.05□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 TFA1YKL028W 1449 nt2.05□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 YFR045WYFR045W 930 nt2.05□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 ALB1YJL122W 528 nt2.05□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 RPB11YOL005C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 AGE1YDR524C 1449 nt2.04□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 SEC3YER008C 4011 nt2.04□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 AGC1YPR021C 2709 nt2.04□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 FOL3YMR113W 1284 nt2.04□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.04□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 PEX5YDR244W 1839 nt2.04□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 EAF5YEL018W 840 nt2.03□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 MTR2YKL186C 555 nt2.03□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 ARR2YPR200C 393 nt2.03□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SNL1YIL016W 480 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YIR014WYIR014W 729 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 CTK2YJL006C 972 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 ERG29YMR134W 714 nt2.03□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 RIC1YLR039C 3171 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 RIF1YBR275C 5751 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 LHS1YKL073W 2646 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 VPS54YDR027C 2670 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YPR097WYPR097W 3222 nt2.02□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 HOS4YIL112W 3252 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 NOP6YDL213C 678 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YAE1YJR067C 426 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 ISF1YMR081C 1017 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YBL073WYBL073W 312 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 TSR4YOL022C 1227 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 TPO5YKL174C 1857 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 ATG32YIL146C 1590 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SYH1YPL105C 2550 nt2.01□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YGR111WYGR111W 1203 nt2□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 PLC1YPL268W 2610 nt2□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 CSE4YKL049C 690 nt2□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 CNS1YBR155W 1158 nt2□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SHE9YDR393W 1371 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SLM1YIL105C 2061 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 EPO1YMR124W 2832 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 MLP2YIL149C 5040 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 ERP3YDL018C 678 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 HPA3YEL066W 540 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 KXD1YGL079W 657 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 COG2YGR120C 789 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 YOR289WYOR289W 756 nt1.99□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SRD1YCR018C 666 nt1.98□□□□□ -2.09
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TY2B-BQ12491 MBA1YBR185C 837 nt1.98□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 VPS3YDR495C 3036 nt1.97□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 MDM32YOR147W 1869 nt1.97□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SPC98YNL126W 2541 nt1.97□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 VPS38YLR360W 1320 nt1.97□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.97□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 POL5YEL055C 3069 nt1.97□□□□□ -2.09
TY2B-BQ12491 SEN15YMR059W 387 nt1.96□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YOL166CYOL166C 339 nt1.96□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt1.96□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt1.96□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.95□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 RRF1YHR038W 693 nt1.95□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 CDC73YLR418C 1182 nt1.95□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 SMP3YOR149C 1551 nt1.95□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 NPL4YBR170C 1743 nt1.95□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 INA17YPL099C 549 nt1.95□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YRR1YOR162C 2433 nt1.94□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 MMS22YLR320W 4365 nt1.94□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 PET100YDR079W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 GRX3YDR098C 858 nt1.94□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 ALG1YBR110W 1350 nt1.94□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 UFD2YDL190C 2886 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 SNO3YFL060C 669 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 EST3YIL009C-A 546 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 RMP1YLR145W 606 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YLR224WYLR224W 1110 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 SNO2YNL334C 669 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 MPD2YOL088C 834 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 CRS5YOR031W 210 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 CYC2YOR037W 1101 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 DBP5YOR046C 1449 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 DAS2YDR020C 699 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 CTH1YDR151C 978 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 RPS18AYDR450W 441 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YCK2YNL154C 1641 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 RDS2YPL133C 1341 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 SNF11YDR073W 510 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 RPL20AYMR242C 519 nt1.91□□□□□ -2.1
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