Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 TPO5YKL174C 1857 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 CIK1YMR198W 1785 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YCG1YDR325W 3108 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 POL2YNL262W 6669 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 STP2YHR006W 1626 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YDL050CYDL050C 372 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RGI1YER067W 486 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YGR053CYGR053C 852 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 EFG1YGR271C-A 702 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RNR2YJL026W 1200 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YLR257WYLR257W 966 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 NNT1YLR285W 786 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 JIP3YLR331C 378 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 VPS20YMR077C 666 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YOR203WYOR203W 354 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 IRC3YDR332W 2070 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.76□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 XRN1YGL173C 4587 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SRP68YPL243W 1800 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 PET100YDR079W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YDR203WYDR203W 318 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 GUK1YDR454C 564 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RMT2YDR465C 1239 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 COBQ0105 1158 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SMX2YFL017W-A 234 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YIP5YGL161C 933 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YLR076CYLR076C 423 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RPL23AYBL087C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 PEX15YOL044W 1152 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RRG7YOR305W 729 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YOR385WYOR385W 873 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YBR063CYBR063C 1215 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 DSE1YER124C 1722 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 AI4Q0065 1671 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 BNI4YNL233W 2679 nt2.75□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 ITC1YGL133W 3795 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 MUS81YDR386W 1899 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YDR491CYDR491C 492 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YJL147CYJL147C 1149 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YKR033CYKR033C 426 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 GRX7YBR014C 612 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YPL107WYPL107W 747 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 LTP1YPR073C 486 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 DOA4YDR069C 2781 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 AYT1YLL063C 1425 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 TSC11YER093C 4293 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 NEW1YPL226W 3591 nt2.74□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 MPS1YDL028C 2295 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 GYP7YDL234C 2241 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 DIA2YOR080W 2199 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 PSK1YAL017W 4071 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 REF2YDR195W 1602 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 snR68snR68 136 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RPL13AYDL082W 600 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RTT105YER104W 627 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RPB9YGL070C 369 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 UPF3YGR072W 1164 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YPT52YKR014C 705 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 MCA1YOR197W 1299 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SPR2YOR214C 711 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SRL1YOR247W 633 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RRP15YPR143W 753 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 DPB3YBR278W 606 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SLP1YOR154W 1764 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 EXO84YBR102C 2262 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RPN3YER021W 1572 nt2.73□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YDR186CYDR186C 2634 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 PDR3YBL005W 2931 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 GCD2YGR083C 1956 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 VPS38YLR360W 1320 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 PSP1YDR505C 2526 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 POL4YCR014C 1749 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RRT13YER066W 558 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 MRPL9YGR220C 810 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 CTK2YJL006C 972 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 CAP1YKL007W 807 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 CCE1YKL011C 1062 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YBL055CYBL055C 1257 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SGT1YOR057W 1188 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 CUP9YPL177C 921 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 LOA1YPR139C 903 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YJL132WYJL132W 2253 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 CSR2YPR030W 3366 nt2.72□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SLN1YIL147C 3663 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 VPS41YDR080W 2979 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 MED1YPR070W 1701 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 PEX18YHR160C 852 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 YAP5YIR018W 738 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 YLR202CYLR202C 327 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 YLR217WYLR217W 324 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 YPT6YLR262C 648 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 YBL065WYBL065W 345 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 EAP1YKL204W 1899 nt2.71□□□□□ -1.98
YPQ1Q12010 SPO71YDR104C 3738 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms