Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN5Q08AF3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms