Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSRP1Q08945 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSRP1Q08945 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms