Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms