Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms