Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms