Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1Q04771 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1Q04771 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms