Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms