Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARDQ03181 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms