Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms