Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC3AQ02505 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms