Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APBA1Q02410 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms