Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms