Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC10Q01780 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms