Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms