Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms