Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP1Q00587 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms