Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms