Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF5P84085 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF5P84085 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF5P84085 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF5P84085 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF5P84085 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF5P84085 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF5P84085 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF5P84085 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms