Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX6P78412 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX6P78412 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX6P78412 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX6P78412 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX6P78412 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX6P78412 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX6P78412 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX6P78412 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX6P78412 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX6P78412 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX6P78412 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX6P78412 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms