Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms