Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms