Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBA52P62987 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBA52P62987 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBA52P62987 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBA52P62987 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBA52P62987 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBA52P62987 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBA52P62987 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBA52P62987 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms