Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP25P60880 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms