Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms