Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP11P59045 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP11P59045 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms