Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASP7P55210 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASP7P55210 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP7P55210 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP7P55210 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP7P55210 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP7P55210 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP7P55210 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP7P55210 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms