Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATN1P54259 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATN1P54259 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATN1P54259 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms