Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PGGT1BP53609 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PGGT1BP53609 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PGGT1BP53609 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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