Protein–RNA interactions for Protein: P53081

NIF3, NGG1-interacting factor 3, yeastyeast

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIF3P53081 RPO41YFL036W 4056 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 ICR1ICR1 3199 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 DPP1YDR284C 870 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 DIG2YDR480W 972 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YEL010WYEL010W 351 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 RPL23BYER117W 414 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YFH7YFR007W 1062 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 ERP6YGL002W 651 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 ERV1YGR029W 570 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YHR180WYHR180W 492 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 ORC2YBR060C 1863 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YLR001CYLR001C 2589 nt2.3□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SAD1YFR005C 1347 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YGL117WYGL117W 798 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 LSM12YHR121W 564 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YHR213WYHR213W 597 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SFT1YKL006C-A 294 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 RPL8BYLL045C 771 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YAR062WYAR062W 597 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 RPS29AYLR388W 171 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 MIC27YNL100W 705 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 MRPL17YNL252C 846 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 GCY1YOR120W 939 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 MRD1YPR112C 2664 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SIN3YOL004W 4611 nt2.29□□□□□ -2.04
NIF3P53081 ANR2YKL047W 1551 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 TRM82YDR165W 1335 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 HMF1YER057C 390 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SEC4YFL005W 648 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YGL204CYGL204C 306 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 OTU2YHL013C 924 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 RPS1AYLR441C 768 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 DIA1YMR316W 1011 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 YIP3YNL044W 531 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 snR35snR35 204 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 AIM4YBR194W 372 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 FAR11YNL127W 2862 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 TFB1YDR311W 1929 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 MUB1YMR100W 1863 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 SLP1YOR154W 1764 nt2.28□□□□□ -2.04
NIF3P53081 MDM36YPR083W 1740 nt2.28□□□□□ -2.05
NIF3P53081 ART10YLR392C 1557 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 KAR1YNL188W 1302 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YPD1YDL235C 504 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 NRG1YDR043C 696 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 HLR1YDR528W 1272 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 HYP2YEL034W 474 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 COG7YGL005C 840 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YGR111WYGR111W 1203 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YJR056CYJR056C 711 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 SRL3YKR091W 741 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YML037CYML037C 1023 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 ADI1YMR009W 540 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 MRPS8YMR158W 468 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YBL055CYBL055C 1257 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 PIS1YPR113W 663 nt2.27□□□□□ -2.05
NIF3P53081 NEL1YHR035W 1893 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 RIM13YMR154C 2184 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 SGM1YJR134C 2124 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 TRA1YHR099W 11235 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YMR046CYMR046C 1323 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 SWA2YDR320C 2007 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 TIM11YDR322C-A 291 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YHR212CYHR212C 336 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 SDO1YLR022C 753 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YAR060CYAR060C 336 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 PDS5YMR076C 3834 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 COQ10YOL008W 624 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YPL150WYPL150W 2706 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YDR061WYDR061W 1620 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 DBP10YDL031W 2988 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 KEL2YGR238C 2649 nt2.26□□□□□ -2.05
NIF3P53081 KRE33YNL132W 3171 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 SPB1YCL054W 2526 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 TRM2YKR056W 1920 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 BIT61YJL058C 1632 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 EMI1YDR512C 564 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YFL015CYFL015C 495 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.25□□□□□ -2.05
NIF3P53081 CUP1-1YHR053C 186 nt2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms