Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCA2P51587 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms