Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBP50607 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBP50607 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBP50607 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBP50607 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBP50607 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBP50607 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBP50607 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBP50607 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms