Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms