Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms