Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRIM1P49642 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms