Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDO2P48775 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDO2P48775 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDO2P48775 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDO2P48775 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDO2P48775 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDO2P48775 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDO2P48775 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDO2P48775 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDO2P48775 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDO2P48775 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDO2P48775 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDO2P48775 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDO2P48775 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TDO2P48775 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms